Դիպլոմային | Ռուսերեն
Эффекты внутри и межмолекулярных взаимодействий перехода спираль-клубок в рамках обобщенной модели полипептидной цепи
referat.am kursayinner referatner diplomayinner tezer պատվիրել աշխատանքներ description_1 <p> </p>
<p>1. B. Alberts, D. Bray, J. Lewis, K. Roberts, J. D. Watson "Molecular Biology of the Cell" Garland publ., New-York, London (1983).</p>
<p>2. A. Yu. Grosberg, A. R. Khоkhlov. "Statistical Physics of Macromolecules" AIP Press, New-York (1994).</p>
<p>3. C. R. Cantor, T. R. Shimmel, "Biophysical Chemistry", Freeman & Co. , San-Francisco (1980).</p>
<p>4. В. Зенгер. "Принципы структурной организации нуклеиновых кислот", М. "Мир" (1987).</p>
<p>5. П. Флори. "Статистическая механика цепных молекул", М. "Мир" (1971).</p>
<p>6. W.L. Mattice, U.W. Suter, "The rotational isomeric state model in macromolecular systems", John Wiley & Sons, Inc. , New York (1996).</p>
<p>7. D.C. Poland, H. A. Sheraga "The Theory of Helix-Coil Transition" Acad. Press, New-York (1970).</p>
<p>8. M.V. Volkenstein "Configurational Statistics of Polymeric Chains", Wiley Interscience (1963).</p>
<p>9. V. G. Dashevskii "Conformational Analysis of Macromolecules", Moscow (1987).</p>
<p>10. L. D. Landau, E. M. Lifshits "Statistical Physics" Pergomon Press, Oxford (1988).</p>
<p>11. В.Ф.Морозов, "Переходы порядок-беспорядок в одномерных макромолекулярных системах", докторская диссертация, Ереван (1996).</p>
<p>12. A.A. Vedenov, A. M. Dykhne, M.D. Frank-Kamenetskii, Usp. Phys. Nauk, v. 105, p. 479 (1971).</p>
<p>13. R. M. Wartell, A. S. Benight, Phys. Rep., v. 126(2), pp. 67-107 (1985).</p>
<p>14. I.A. Shellman. The stability of Hydrogen Bonded peptide structures in aqueous solution. Compt. Rend. Trav. Lab. Carlsberg, Ser. Chim., 29, 230 (1955).</p>
<p>15. I.A. Shellman. The stability of Hydrogen Bonded peptide structures in aqueous solution. Compt. Rend. Trav. Lab. Carlsberg, Ser. Chim., 29, 223 (1955).</p>
<p>16. I.H. Gibbs, E.A. Dimarzio, "Statistical Mechanics of Helix-Coil Transitions Biological Macromolecules" J. Chem. Phys., 30, 271 (1959).</p>
<p>17. T. L. Hill, "Generalization of the One-Dimensional Ising Model Applicable to Helix Transitions in Nucleic Acids and Proteins", J.Chem.Pliys., 30, № 2, 383 (1959)</p>
<p>18. B. H. Zimm, P. Doty, K. Iso, Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 45, 1601-1607 (1959).</p>
<p>19. B. H. Zimm, J. K. Bragg, J. Chem. Phys., v. 31, pp. 526-535 (1959).</p>
<p>20. B. H. Zimm, J. Chem. Phys., v. 33, N. 5, pp. 1349-1356 (1960).</p>
<p>21. B. H. Zimm, N. Rice, Mol. Phys., v. 3, N. 4, pp. 391-407 (1960).</p>
<p>22.S. Lifson, A. Roig,"On the theory of helix-coil transition in polypeptides",J. Chem. Phys. 34, 1963-1974 (1961).</p>
<p>23. S. Lifson, B. H. Zimm, Biopolymers, v.1, pp. 1-15 (1963).</p>
<p>24. S. Lifson, J. Allegra, Biopolymers, v. 2, N. 1, p. 65 (1964).</p>
<p>25. M. D. Frank-Kamenetskii, Mol. Biol., v. 2, N. 3, p. 408 (1968).</p>
<p>26. M. D. Frank-Kamenetskii, A. T. Karapetyan, Mol. Biol., v. 6, pp. 621 (1972).</p>
<p>27. M.D. Frank-Kamenetskii. Biophysics-Nucleic Acids. Springer, 1998.</p>
<p>28. M.D. Frank-Kamenetskii, A.D. Frank-Kamenetskii. Mol. Biol. (Russ.), 3, 375 (1969).</p>
<p>29. M. Peyrard, A.R. Bishop. Statistical Mechanics of a Nonlinear model for DNA denaturation. Phys. Rev. Lett., 62, № 23, 2755 (1989).</p>
<p>30. Thierry Dauxois, M. Peyrard, A.R. Bishop. Dynamics and thermodynamics of a nonlinear model for DNA denaturation. Rap. Comm. Phys. Rev. E, 47, № 1, 684 (1993).</p>
<p>31. Thierry Dauxois, M. Peyrard, A.R. Bishop. Entropy-drive DNA denatutation. Phys. Rev. Lett, 47, № 1, R44 (1993).</p>
<p>32. Nikos Theodorakopulos, Thierry Sauxois, Michel Peyrard. Order of the phase transition in models of DNA thermal denaturation. Phys. Rev. E, 85, № 1, 6 (2000).</p>
<p>33. M.Peyrard. Nonlinear dynamics and statistical physics of DNA. Nonlinearity, 17, R1 (2004).</p>
<p>34. D. Cule, T. Hwa, "Denaturation of heterogeneous DNA",Phys.Rev. Lett. v. 79 (12) (1997).</p>
<p>35.A. Wada, A. Suyama, "Local stability of DNA and RNA secondary structure and its relation to biological functions", Prog. Biophys. Mol Biol., v.47, pp.113-157 (1986) .</p>
<p>36. M.Takano, K. Nagayama, A. Suyama, "Investigating a link between all-atom model simulation and the Ising-based theory of the helix-coil transition: Equilibrium statistical mechanics", J. of Chem. Phys., 116, 5 (2002).</p>
<p>37. T. Garel, C. Monthus, H. Orland, "A simple model for DNA denaturation", Europhysics Lett., 55 (1), (2001)</p>
<p>38. Marco Baiesi, Enrico Carlon, Enzo Orlandini, Attilio L. Stella, Cond-Mat/0207122 v 1.(2002).</p>
<p>39. Yong-li Zhang,Wei-Mou Zheng, Ji-Xing Liu, Y.Z. Chen. Theory of DNA melting based on the Peyrard-Bishop model. Phys. Rev. E, 56, № 6, 7100 (1997).</p>
<p>40. D.C. Poland, H. A. Sheraga, "Comparison of theories of the helix-coil transition in polypeptides", J.Chem.Phys., v 43, p. 2071, (1965).</p>
<p>41. N.A. Alves, U.H.E. Hansmann, "Partition function zeroes and finite size scaling of helix-coil transitions in a polypeptide", Phys.Rev.Lett., v. 84, N. 8, pp. 1836-1839 (2000).</p>
<p>42. N. Foloppe, L. Nilsson, A.D. MacKerell Jr., "Ab initio conformational analysis of nucleic acid components: Intrinsic energetic contributions to nucleic acid structure and dynamics", Biopolymers, V. 61, Issue 1, pp. 61-76 (2001).</p>
<p>43. P-G de Gennes "Scaling Concept in Polymer Physics" Cornell University Press. Ithaca (1979).</p>
<p>44. N.S Ananikyan, Sh. A. Haryan, E . Sh. Mamasakhlisov, V. F. Morozov, Biopolymers, v. 30, pp. 357-367 (1990).</p>
<p>45. Sh. A. Haryan, E . Sh. Mamasakhlisov, V. F. Morozov, Biopolymers, v. 35, pp. 75-84 (1995).</p>
<p>46. N.S. Ananikyan, E. Sh. Mamasakhlisov, V. F. Morozov, Z. Phys. Chem, Leipzig, v. 27, N. 3, p. 603 (1993).</p>
<p>47. Ш. А. Айрян, Н.С. Ананикян, Е.Ш. Мамасахлисов, В.Ф. Морозов. Биофизика, 34, вып.3, 394 (1989).</p>
<p>48. V. F. Morozov, E. Sh. Mamasakhlisov, Sh. A. Haryan, Chin-Kun Hu, Physica A, v. 281, pp. 1-4, 51-59 (2000).</p>
<p>49. Wu. F. Y., Rev. Mod. Phys., v. 54, pp. 3720-3730 (1982).</p>
<p>50. R. Baxter, J. Phys. C., v. 6, pp. 445-449 (1973).</p>
<p>51. N. S. Ananikyan, N.S. Izmailyan, Phys. Lett. B., v. 151, pp. 142-144 (1985).</p>
<p>52. Z. Glumac, k. Uzelac, "The partition function zeros in the one-dimensional q-state Potts model", J.Phys.A, v.27, pp.7709-7717 (1994).</p>
<p>53. Seung-Yeon Kim, R.J. Creswick, "Fisher zeros of the Q-state Potts model in the complex temperature plane for nonzero external magnetic field", Phys.Rev.E, v.58,N6,pp. 7006-7012, (1998).</p>
<p>54. R.G. Ghulghazaryan, N.S. Ananikian, "Partition function zeros of the one-dimensional Potts model: the recursive method.", J.Phys.A, v.36, pp. 6297-6312, (2003).</p>
<p>55. M. Elstner, P. Hobza, T. Frauenheim, S. Suhai, E. Kaxiras, "Hydrogen bonding and stacking interactions of nucleic acid base pairs: A density-functional-theory based treatment", J.Chem.Phys., v.114, N12, pp.5149-5155 (2001).</p>
<p>56. L.R. Pratt, MOLECULAR THEORY OF HYDROPHOBIC EFFECTS: "She is too mean to have her name repeated.", Annu. Rev. Phys. Chem., v.53(1), pp. 409 - 436 (2002).</p>
<p>57. A. Irback, E. Sandelin, "On Hydrophobicity Correlations in Protein Chains", Biophys. J, pp. 2252-2258, Vol. 79, No. 5 (2000).</p>
<p>58. Ray Luo, Hillary S. R. Gilson, M.J. Potter, M.K. Gilson , "The Physical Basis of Nucleic Acid Base Stacking in Water", Biophys. J, pp. 140-148, Vol. 80, No. 1 (2001).</p>
<p>59. J.A. Vila, D.R. Ripoll, M.E. Villegas, Yury N. Vorobjev, H.A. Scheraga, "Role of Hydrophobicity and Solvent-Mediated Charge-Charge Interactions in Stabilizing alfa-helices", Biophys. J, pp. 2637-2646, Vol. 75, No. 6 (1998).</p>
<p>60. R.D. Parra, S. Bulusu, X.C. Zeng, "Cooperative effects in one-dimensional chains of three center hydrogen bonding interactions", J.Chem.Phys., v.118, N8, p.3499 (2003).</p>
<p>61. Z.-C. OU-Yang, H.Zhou, Y. Zhang, "The elastic theory of a single DNA molecule", Mod.Phys.Lett. B, v.17, N1, pp. 1-10 (2003).</p>
<p>62. Z.-C. OU-Yang, "The elastic theory of a single DNA molecule", Int, J. Mod. Phys. B, v.17, N 1&2, pp. 69-75 (2003).</p>
<p>63. В.М. Асланян, Т.М. Бирштейн, П. Луизи. Оптическая активность и конформации макромолекул. В сб. "Оптические исследования в жидкостях и растворах". Изд. "Наука", 1965.</p>
<p>64. В.М. Волькенштейн, В.М. Асланян. Оптическая активность и межмолекулярное взаимодействие. Оптика и спектроскопия, 7, № 2, 208 (1959).</p>
<p>65. I. Rouzina, V.A. Bloomfield, „Biophys. J.",v.80, 882-893 (2001).</p>
<p>66. I. Rouzina, V.A. Bloomfield, „Biophys. J.",v.80, 894-900 (2001).</p>
<p>67. J.T. Alter, G.T. Taylor, H.A. Scheraga. Helix-Coil stability constants for the Naturally Occuring Amino Acids in Water. VI. Leucine Parameters from Random Poly (hydroxybutylglutamine-co-L-leucine). Macromolecules, 5, № 6, 739 (1972).</p>
<p>68. V.S. Ananthanarayanan, E. Levory & H.A. Scheraga. Helix-Coil Transition in Mixed Solvents. I. Optical Ratatory Dispersion Study of Poly( -benzyl-L-glutamate) in Dichloracetic Acid-Dichloroethane Mixtures. Macromolecules, 6, № 4, 553 (1973).</p>
<p>69. V.S. Ananthanarayanan, R.H. Andreatta, D.C. Poland & H.A. Scheraga. Helix-Coil Stability Constants for the Naturally Occuring Amino Acids in Water. III. Glycine Parameters from Random Poly(hydroxybutylglutamine-co-glycine). Macromolecules, 4, № 4, 417 (1971).</p>
<p>70. П. Доти. Конфигурации биологически важных макромолекул в растворе. В сборнике "Современные проблемы биофизики", т.1, изд. "Ин. Лит.", стр. 138-151, 1961.</p>
<p>71. M. Bixon & S. Lifson. Solvent Effects on the Helix-Coil Transition in Polypeptides. Biopolymers, 4, №8, 815 (1966).</p>
<p>72. L. Peller. On a Model for the Helix-Random Coil Transition in polypeptides. I. The Model and its Thermal Behavior. J. Phys. Chem., 63, № 7, 1194 (1959).</p>
<p>73. L. Peller. On a Model for the Helix-Random Coil Transition in polypeptides. II. The influence of Solvent Composition and Charge interactions on the Transition. J. Phys. Chem., 63, № 7, 1199 (1959).</p>
<p>74. I. Haq, J. Ladbury, "Drug-DNA recognition: energetics and implications for design", Journal of Molecular Recognition, V. 13, Issue 4, pp. 188-197 (2000).</p>
<p>75. D. Szwajkajzer, J. Carey, "Molecular and biological constraints on ligand-binding affinity and specificity", Biopolymers, V. 44, Issue 2, pp. 181-198 (1997).</p>
<p>76. J.A. Schellman, H.R. Reese, "Extensions to the theory of intercalation", Biopolymers,</p>
<p>V. 39, Issue 2, pp. 161-171 (1996).</p>
<p>77. K. E. S. Tang, V. A. Bloomfield, "Assessing Accumulated Solvent Near a Macromolecular Solute by Preferential Interaction Coefficients", Biophys. J., v.82(6), pp. 2876 - 2891 (2002).</p>
<p>78. V.S. Pande, A.Yu. Grosberg, T. Tanaka, "Heteropolymer freezing and design: Towards physical models of protein folding", Rev. Mod. Phys., V. 72, No. 1, pp. 259-314 (2000).</p>
<p>79. A.S. Benight, F.J. Gallo, T.M. Paner, K.D. Bishop, B.D. Faldasz, M.J. Lane, "Sequence context and DNA reactivity: Application to sequence-specific cleavage of DNA", Adv. Biophys. Chem., v.5, pp. 1-55 (1995).</p>
<p>80. R. Owczarzy, P.M. Vallone, F.J. Gallo, T.M. Paner, M.J. Lane, A.S. Benight, "Predicting sequence-dependent melting stability of short duplex DNA oligomers", Biopolymers, V. 44, Issue 3, pp. 217-239 (1997).</p>
<p>81. D.G. Wallace, K.A. Dill, "Treating sequence dependence of protein stability in a mean-field model", Biopolymers, V. 39, Issue 1, pp. 115-127 (1996).</p>
<p>82. C. Anselmi, G. Bocchinfuso, P. De Santis, M. Savino, A. Scipioni, "A Theoretical Model for the Prediction of Sequence-Dependent Nucleosome Thermodynamic Stability", Biophys J, pp. 601-613, Vol. 79, No. 2 (2000).</p>
<p>83. A. E. Vinogradov, "DNA helix: the importance of being GC-rich"</p>
<p>Nucleic Acids Res., v. 31(7), pp. 1838 - 1844 (2003).</p>
<p>84. Б. Н. Белинцев, А.В. Гагуа, Мол. Биол., т. 23, в.1, стр. 52-60 (1989).</p>
<p>85. Y. Zhang, D.M. Crothers, "Statistical Mechanics of Sequence-Dependent Circular DNA and Its Application For DNA Cyclization", Biophysical J., v. 84, pp. 136-153 (2003).</p>
<p>86. M. Fixman and D. Zeroka. Helix-Coil Transition in Heterogeneous Chains. I. Protein Model. J. Chem. Phys., 48, 5223 (1968).</p>
<p>87. W.B. Melchior, P.H. von Hippel. Alteration of the relative stability of dAodT and dGodC base pairs in DNA. Proc. Nat. Acad. Sci. U.S., 70, № 2, 298 (1973).</p>
<p>88. А.Д. Воскобойник, Д.Р. Монаселидзе, Г.Н. Мгеладзе и др. Исследование плавления ДНК в области инверсии относительной стабильности AT- и GC-пар. Молекул. биология., 9, № 5, 783 (1975).</p>
<p>89. O. Farago, P. Pincus, "Solute effects on the helix-coil transition", Eur. Phys. J. E, v.8, pp. 393–396 (2002).</p>
<p>90. N. Go, M. Go and H.A. Scheraga. Molecular Theory of the Helix-Coil Transition in Polyamino Acids. III. Evaluation and Analysis of and for Polyglycine and Poly-L-Alanine in Water. J. Chem. Phys., 54, № 10, 4489, (1971).</p>
<p>91. N. Go, M. Go and H.A. Scheraga. Molecular Theory of the Helix-Coil Transition in Polyamino Acids. IV. Evaluation Analysis of the s for Poly (L-valine) in the Absence and Presence of Water. Macromolecules, 7, № 4, 459 (1974).</p>
<p>92. M. Go and H.A. Scheraga. Molecular Theory of the Helix-Coil Transition in Polyamino Acids. V. Explanation of the Different Conformational Behavior of Valine, Isoleucine and Leucine in Aqueous Solution. Biopolymers, 23, 1961 (1984).</p>
<p>93. I.E. Alter, G.T. Taylor and H.A. Scheraga. Helix-Coil Stability Constants for the Naturally Occuring Amino Acids in Water. VI. Leucine Parameters from Random Poly(hydroxypropylglutamine-co-L-leu-cine and Poly(hydroxybutylglutamine-co-L-leucine). Macromolecules, 5, № 6, 739 (1972).</p>
<p>94. A. Kidera, M. Mochizuki, R. Hasegawa, T. Hayashi, H. Sato, A. Nakajima, R.A. Fredrickson, S.P. Powers, S. Lee and H.A. Scheraga. Helix-Coil Transition in Multicomponent Random Copolypeptides in Water. I. Theory and Application to Random Copolymers of (Hydroxypropyl)-L-glytamine, L-alanine and glycine. Macromolecules, 16, № 2, 162 (1983).</p>
<p>95. F.E. Karasz & T.M. O'Reilly. Deuteration and Solvent Composition Effects in the Helix-Coil Transition of Poly- - benzyl-L-glutamate. Biopolimers, 4, № 9, 1015 (1966).</p>
<p>96. K. Okita, A. Teramoto & H. Fujita. Solution Properties of Synthetic Polypeptides. VI. Helix-Coil Transition of Poly-N-(3-hydroxypropyl)-L-glutamine. Biopolymers, 9, № 6, 717 (1966).</p>
<p>97. R. Weil, J. Vinograd. The cyclic helix and cyclic coil forms of polyoma viral DNA. Ibid, 50, № 3, 730 (1963).</p>
<p>98. A. Colman, P.R. Cook. Transcription of superhelical DNA from cell nuclei. Europ. J. Biochem., 76, № 1, 63 (1977).</p>
<p>99. Yu. L. Lyubchenko, M.D. Frank-Kamenetskii, A.V. Vologodskii, Yu.S. Lazurkin, G.G. Gause. Biopolymers, 15, 1019 (1976).</p>
<p>100. A.V. Gagua, B.N. Belintsev, Yu.L. Lyubchenko. Effect of base pairs stability on the melting of superhelical DNA. Nature, 294, 662 (1981).</p>
<p>101. А.В. Вологодский. Топология и физические свойства кольцевых ДНК. М. "Наука", 1988.</p>
<p>102. D. Sprous, R.K.-Z. Tan, S.C. Harvey , "Molecular modeling of closed circular DNA thermodynamic ensembles", Biopolymers, V. 39, Issue 2, pp. 243-258 (1996).</p>
<p>103. J.H. White, R.A. Lund, W.R. Bauer, "Twist, writhe, and geometry of a DNA loop containing equally spaced coplanar bends", Biopolymers, V. 38, Issue 2, pp. 235-250 (1996).</p>
<p>104. Y. Zhang, D. M. Crothers, "Statistical Mechanics of Sequence-Dependent Circular DNA and Its Application For DNA Cyclization", Biophys. J., v. 84(1), pp. 136 - 153 (2003).</p>
<p>105. А.В. Бадасян, А.В. Григорян, А.Ю. Чухаджян, Е.Ш. Мамасахлисов, В.Ф. Морозов. Переход спираль-клубок в кольцевых замкнутых ДНК в присутствии конкурентного растворителя. Известия НАН Армении, Физика, 37, N1, 59 (2002).</p>
<p>106. V. Munoz, L. Serrano, "Development of the Multiple sequence Approximation within the AGADIR model of alpha-helix formation: comparison with Zimm-Bragg and Lifson-Roig formalisms", Biopolymers, v. 41, pp. 495-509 (1997).</p>
<p>107. А.В. Бадасян, А.В. Григорян, А.Ю. Чухаджян, Е.Ш. Мамасахлисов, В.Ф. Морозов, "Гамильтониан и характеристическое уравнение для обобщения модели перехода спираль-клубок с учетом стекинга", Известия НАН Армении, Физика, т.37, N5, с.320-322 (2002).</p>
<p>108. V.F. Morozov, А.V. Badasyan, A.V. Grigoryan, M.A. Sahakyan, E.Sh. Mamasakhlisov, "Stacking and Hydrogen Bonding. DNA Cooperativity at Melting.", Biopolymers, v.75, issue 5, pp. 434-439 (2004).</p>
<p>109. A.Crisanti, G.Paladin, A. Vulpiani, „Products of Random Matrices in Statistical Physics", Springer-Verlag, Berlin (1993).</p>
<p>110. А.В. Бадасян, "Переход спираль-клубок в гетерополимерах. Микроканонический метод.", Известия НАН Армении, Физика, т.39, N1, с. 53-59 (2004).</p>
<p>111. A.V. Badasyan, A.V. Grigoryan, E.Sh.Mamasakhlisov, V.F.Morozov, "Role of heterogeneity in helix-coil transition in biopolymers", Statistical Physics and Dynamical Systems: Methods and Applications, Nor-Amberd, Armenia, 2003, Book of abstracts, p.9.</p>
<p>112. A.V. Badasyan, A.V. Grigoryan, E.Sh.Mamasakhlisov, V.F.Morozov, "The helix-coil transition in heterogeneous double stranded DNA. Microcanonical method.", X International Conference on Symmetry Methods in Physics, Yerevan, Armenia, 2003, Book of Abstracts, Page 10.</p>
<p>113. A.V. Badasyan, A.V. Grigoryan, E.Sh.Mamasakhlisov, V.F.Morozov, "Order-disorder transition in one-dimensional system with disorder in composition.", Physics of Atomic Nuclei, v. 68, N. 8 (2005). </p>
<p>114. А.В. Бадасян, А.В. Григорян, А.Ю. Чухаджян, Е.Ш.Мамасахлисов, В.Ф. Морозов, "Переход спираль-клубок в кольцевых замкнутых гетерополимерных ДНК", Известия НАН Армении, Физика, т.37, N4, с. 250-253 (2002).</p>
<p>115. A.V. Badasyan, V.F. Morozov, E.Sh.Mamasakhlisov, "Influence of chain heterogeneity on the helix-coil transition in circular closed DNA", StatPhys-Taiwan-2002, Lattice models and complex systems, Book of abstracts, p. 37.</p>
<p> </p>
description_2 <p>Введение</p>
<p>1.Литературный Обзор </p>
<p>Структурные особенности биополимеров.</p>
<p>Теоретические подходы к описанию перехода спираль-клубок.</p>
<p>Модель Зимма-Брегга</p>
<p>Модель Лифсона - Ройга и другие модели перехода спираль-клубок</p>
<p>Модель Поттса и ее применения</p>
<p>Симуляционные модели и модель Пейрара-Бишопа</p>
<p>Обобщенная Модель Полипептидной Цепи (ОМПЦ).</p>
<p>Обоснование модели</p>
<p>Трансфер-матрица и вековое уравнение</p>
<p>Статсумма для произвольного N</p>
<p>2 Характеристики ОМПЦ </p>
<p>2.2 Степень спиральности </p>
<p>2.3 Средняя доля спирального состояния </p>
<p>2.4 Корреляционная функция и длина </p>
<p>2.5 Свободная Энергия Внутренняя Энергия </p>
<p>2.7. Энталпия </p>
<p>2.8.Потенциал Гиббса</p>
<p>3. Обобщенная Модель Полипептидной Цепи (ОМПЦ) В КОНКУРЕНТНОМ И НЕКОНКУРЕНТНОМ РАСТВОРИТЕЛЕ</p>
<p>3.1 Конкурентный растворитель</p>
<p>3.2. Неконкурентный растворитель</p>
<p>3.3. Гамильтониан и преобразование параметров.</p>
<p>3.3. Обсуждение и выводы. </p>
<p>5 Взаимодействие двух цепей ОМПЦ </p>
<p>5.1 Построение задачи и трансфер-матрицы </p>
<p>5.2 Степень спиральности </p>
<p>5.3 Средняя доля спирального состояния</p>
title_arm Эффекты внутри и межмолекулярных взаимодействий перехода спираль-клубок в рамках обобщенной модели полипептидной цепи title_eng convertot_1 Эффекты внутри и межмолекулярных взаимодействий перехода спираль-клубок в рамках обобщенной модели полипептидной цепи convertot_2 Эффекты внутри и межмолекулярных взаимодействий перехода спираль-клубок в рамках обобщенной модели полипептидной цепи convertot_3 Эффекты внутри и межмолекулярных взаимодействий перехода спираль-клубок в рамках обобщенной модели полипептидной цепи convertot_4 Эффекты внутри и межмолекулярных взаимодействий перехода спираль-клубок в рамках обобщенной модели полипептидной цепи convertot_5 Эффекты внутри и межмолекулярных взаимодействий перехода спираль-клубок в рамках обобщенной модели полипептидной цепи convertot_6 Эффекты внутри и межмолекулярных взаимодействий перехода спираль-клубок в рамках обобщенной модели полипептидной цепи convertot_7 Эффекты внутри и межмолекулярных взаимодействий перехода спираль-клубок в рамках обобщенной модели полипептидной цепи convertot_8 Эффекты внутри и межмолекулярных взаимодействий перехода спираль-клубок в рамках обобщенной модели полипептидной цепи convertot_9 Эффекты внутри и межмолекулярных взаимодействий перехода спираль-клубок в рамках обобщенной модели полипептидной цепи convertot_10 Эффекты внутри и межмолекулярных взаимодействий перехода спираль-клубок в рамках обобщенной модели полипептидной цепи convertot_11 Эффекты внутри и межмолекулярных взаимодействий перехода спираль-клубок в рамках обобщенной модели полипептидной цепи convertot_13 Эффекты внутри и межмолекулярных взаимодействий перехода спираль-клубок в рамках обобщенной модели полипептидной цепи convertot_14 Эффекты внутри и межмолекулярных взаимодействий перехода спираль-клубок в рамках обобщенной модели полипептидной цепи convertot_15 Эффекты внутри и межмолекулярных взаимодействий перехода спираль-клубок в рамках обобщенной модели полипептидной цепи convertot_16 Эффекты внутри и межмолекулярных взаимодействий перехода спираль-клубок в рамках обобщенной модели полипептидной цепи convertot_17 Эффекты внутри и межмолекулярных взаимодействий перехода спираль-клубок в рамках обобщенной модели полипептидной цепи convertot_18 Эффекты внутри и межмолекулярных взаимодействий перехода спираль-клубок в рамках обобщенной модели полипептидной цепи